Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GASTP01350 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GASTP01350 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GASTP01350 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GASTP01350 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GASTP01350 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GASTP01350 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GASTP01350 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GASTP01350 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GASTP01350 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GASTP01350 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GASTP01350 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GASTP01350 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GASTP01350 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GASTP01350 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GASTP01350 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GASTP01350 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GASTP01350 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GASTP01350 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GASTP01350 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GASTP01350 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GASTP01350 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GASTP01350 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GASTP01350 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GASTP01350 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GASTP01350 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GASTP01350 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GASTP01350 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GASTP01350 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GASTP01350 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GASTP01350 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GASTP01350 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GASTP01350 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GASTP01350 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GASTP01350 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GASTP01350 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GASTP01350 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GASTP01350 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GASTP01350 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GASTP01350 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GASTP01350 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GASTP01350 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GASTP01350 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GASTP01350 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GASTP01350 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GASTP01350 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GASTP01350 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GASTP01350 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GASTP01350 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GASTP01350 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GASTP01350 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GASTP01350 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GASTP01350 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GASTP01350 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GASTP01350 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GASTP01350 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GASTP01350 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GASTP01350 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GASTP01350 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GASTP01350 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GASTP01350 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GASTP01350 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GASTP01350 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GASTP01350 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GASTP01350 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GASTP01350 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GASTP01350 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GASTP01350 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GASTP01350 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GASTP01350 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GASTP01350 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GASTP01350 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GASTP01350 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GASTP01350 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GASTP01350 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GASTP01350 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms