Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPP00450 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPP00450 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPP00450 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPP00450 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPP00450 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPP00450 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPP00450 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CPP00450 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPP00450 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPP00450 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPP00450 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPP00450 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPP00450 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPP00450 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPP00450 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPP00450 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPP00450 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPP00450 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPP00450 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPP00450 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPP00450 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPP00450 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPP00450 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPP00450 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPP00450 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPP00450 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPP00450 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPP00450 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPP00450 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPP00450 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPP00450 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPP00450 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPP00450 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPP00450 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPP00450 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPP00450 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPP00450 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPP00450 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPP00450 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPP00450 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPP00450 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPP00450 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPP00450 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPP00450 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPP00450 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPP00450 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPP00450 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPP00450 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPP00450 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPP00450 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CPP00450 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPP00450 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPP00450 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CPP00450 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPP00450 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPP00450 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPP00450 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPP00450 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPP00450 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPP00450 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CPP00450 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPP00450 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPP00450 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPP00450 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPP00450 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPP00450 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPP00450 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CPP00450 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPP00450 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPP00450 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPP00450 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPP00450 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPP00450 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPP00450 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPP00450 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPP00450 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPP00450 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPP00450 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms