Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD3O95983 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD3O95983 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD3O95983 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD3O95983 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD3O95983 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD3O95983 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MBD3O95983 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD3O95983 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD3O95983 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD3O95983 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD3O95983 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD3O95983 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MBD3O95983 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD3O95983 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD3O95983 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD3O95983 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD3O95983 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD3O95983 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD3O95983 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD3O95983 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD3O95983 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD3O95983 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD3O95983 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD3O95983 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD3O95983 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD3O95983 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD3O95983 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD3O95983 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD3O95983 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD3O95983 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD3O95983 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MBD3O95983 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MBD3O95983 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD3O95983 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD3O95983 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD3O95983 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD3O95983 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD3O95983 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD3O95983 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD3O95983 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD3O95983 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD3O95983 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD3O95983 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD3O95983 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD3O95983 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD3O95983 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD3O95983 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD3O95983 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD3O95983 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD3O95983 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD3O95983 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD3O95983 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD3O95983 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD3O95983 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD3O95983 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD3O95983 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD3O95983 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MBD3O95983 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD3O95983 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD3O95983 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD3O95983 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD3O95983 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MBD3O95983 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MBD3O95983 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MBD3O95983 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MBD3O95983 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MBD3O95983 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MBD3O95983 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD3O95983 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD3O95983 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD3O95983 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD3O95983 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD3O95983 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD3O95983 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD3O95983 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MBD3O95983 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MBD3O95983 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms