Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX6O95503 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX6O95503 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX6O95503 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CBX6O95503 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX6O95503 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX6O95503 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX6O95503 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX6O95503 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX6O95503 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX6O95503 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX6O95503 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CBX6O95503 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX6O95503 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX6O95503 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX6O95503 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX6O95503 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX6O95503 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX6O95503 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX6O95503 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CBX6O95503 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX6O95503 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX6O95503 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX6O95503 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX6O95503 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX6O95503 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX6O95503 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CBX6O95503 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX6O95503 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX6O95503 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX6O95503 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX6O95503 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX6O95503 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX6O95503 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX6O95503 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX6O95503 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CBX6O95503 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX6O95503 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX6O95503 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX6O95503 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX6O95503 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX6O95503 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX6O95503 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX6O95503 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX6O95503 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX6O95503 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX6O95503 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX6O95503 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX6O95503 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX6O95503 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX6O95503 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX6O95503 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX6O95503 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX6O95503 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX6O95503 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX6O95503 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX6O95503 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX6O95503 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX6O95503 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX6O95503 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX6O95503 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms