Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPBO95292 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPBO95292 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPBO95292 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPBO95292 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPBO95292 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPBO95292 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPBO95292 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAPBO95292 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAPBO95292 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAPBO95292 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAPBO95292 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAPBO95292 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAPBO95292 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAPBO95292 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAPBO95292 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAPBO95292 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAPBO95292 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAPBO95292 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAPBO95292 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAPBO95292 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAPBO95292 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAPBO95292 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPBO95292 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPBO95292 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPBO95292 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPBO95292 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPBO95292 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAPBO95292 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAPBO95292 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPBO95292 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPBO95292 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPBO95292 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPBO95292 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPBO95292 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPBO95292 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPBO95292 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPBO95292 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAPBO95292 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAPBO95292 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAPBO95292 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPBO95292 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPBO95292 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPBO95292 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAPBO95292 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms