Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCGO76070 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCGO76070 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCGO76070 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCGO76070 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCGO76070 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCGO76070 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCGO76070 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCGO76070 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCGO76070 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCGO76070 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCGO76070 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCGO76070 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCGO76070 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCGO76070 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCGO76070 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCGO76070 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNCGO76070 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNCGO76070 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNCGO76070 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNCGO76070 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms