Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB3O75712 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB3O75712 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB3O75712 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB3O75712 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB3O75712 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJB3O75712 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB3O75712 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB3O75712 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB3O75712 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB3O75712 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB3O75712 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB3O75712 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB3O75712 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB3O75712 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJB3O75712 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJB3O75712 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJB3O75712 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB3O75712 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB3O75712 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB3O75712 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB3O75712 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB3O75712 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB3O75712 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB3O75712 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GJB3O75712 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB3O75712 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB3O75712 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB3O75712 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB3O75712 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB3O75712 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB3O75712 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB3O75712 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GJB3O75712 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GJB3O75712 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB3O75712 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB3O75712 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB3O75712 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB3O75712 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB3O75712 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB3O75712 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJB3O75712 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJB3O75712 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB3O75712 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB3O75712 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB3O75712 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB3O75712 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJB3O75712 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB3O75712 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJB3O75712 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB3O75712 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB3O75712 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB3O75712 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB3O75712 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB3O75712 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJB3O75712 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB3O75712 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB3O75712 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB3O75712 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB3O75712 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB3O75712 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB3O75712 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB3O75712 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJB3O75712 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB3O75712 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB3O75712 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB3O75712 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB3O75712 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJB3O75712 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJB3O75712 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms