Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFPL3O75679 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFPL3O75679 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RFPL3O75679 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms