Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX2O60749 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX2O60749 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX2O60749 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX2O60749 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX2O60749 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX2O60749 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX2O60749 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX2O60749 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX2O60749 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX2O60749 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX2O60749 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX2O60749 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX2O60749 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX2O60749 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX2O60749 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX2O60749 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX2O60749 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX2O60749 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX2O60749 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX2O60749 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX2O60749 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX2O60749 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX2O60749 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX2O60749 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX2O60749 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX2O60749 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX2O60749 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX2O60749 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX2O60749 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX2O60749 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX2O60749 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX2O60749 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX2O60749 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX2O60749 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX2O60749 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX2O60749 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX2O60749 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX2O60749 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX2O60749 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX2O60749 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX2O60749 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX2O60749 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX2O60749 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX2O60749 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX2O60749 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX2O60749 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX2O60749 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX2O60749 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX2O60749 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX2O60749 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX2O60749 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX2O60749 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms