Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TBX1O43435 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBX1O43435 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBX1O43435 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBX1O43435 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBX1O43435 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBX1O43435 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TBX1O43435 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TBX1O43435 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TBX1O43435 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TBX1O43435 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBX1O43435 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBX1O43435 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBX1O43435 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBX1O43435 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TBX1O43435 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBX1O43435 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBX1O43435 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBX1O43435 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TBX1O43435 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TBX1O43435 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBX1O43435 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBX1O43435 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBX1O43435 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TBX1O43435 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBX1O43435 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBX1O43435 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBX1O43435 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TBX1O43435 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBX1O43435 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBX1O43435 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBX1O43435 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBX1O43435 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBX1O43435 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBX1O43435 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBX1O43435 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBX1O43435 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TBX1O43435 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TBX1O43435 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBX1O43435 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBX1O43435 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBX1O43435 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TBX1O43435 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TBX1O43435 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TBX1O43435 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBX1O43435 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBX1O43435 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TBX1O43435 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TBX1O43435 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TBX1O43435 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TBX1O43435 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBX1O43435 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBX1O43435 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBX1O43435 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBX1O43435 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBX1O43435 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBX1O43435 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBX1O43435 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBX1O43435 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBX1O43435 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TBX1O43435 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms