Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID2O43424 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRID2O43424 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRID2O43424 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRID2O43424 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRID2O43424 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRID2O43424 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRID2O43424 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRID2O43424 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRID2O43424 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRID2O43424 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID2O43424 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID2O43424 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID2O43424 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID2O43424 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID2O43424 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID2O43424 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID2O43424 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID2O43424 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID2O43424 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID2O43424 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRID2O43424 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID2O43424 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID2O43424 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID2O43424 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID2O43424 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID2O43424 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRID2O43424 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRID2O43424 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID2O43424 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID2O43424 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID2O43424 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID2O43424 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID2O43424 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRID2O43424 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRID2O43424 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRID2O43424 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRID2O43424 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRID2O43424 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRID2O43424 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID2O43424 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID2O43424 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID2O43424 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID2O43424 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID2O43424 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID2O43424 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID2O43424 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID2O43424 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID2O43424 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRID2O43424 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRID2O43424 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms