Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASKO14936 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASKO14936 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASKO14936 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASKO14936 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASKO14936 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASKO14936 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASKO14936 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASKO14936 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASKO14936 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASKO14936 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASKO14936 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASKO14936 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASKO14936 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASKO14936 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASKO14936 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASKO14936 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CASKO14936 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASKO14936 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CASKO14936 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASKO14936 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASKO14936 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASKO14936 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASKO14936 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASKO14936 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASKO14936 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CASKO14936 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASKO14936 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASKO14936 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CASKO14936 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASKO14936 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASKO14936 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASKO14936 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASKO14936 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CASKO14936 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASKO14936 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASKO14936 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CASKO14936 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASKO14936 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASKO14936 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASKO14936 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASKO14936 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASKO14936 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASKO14936 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASKO14936 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASKO14936 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASKO14936 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CASKO14936 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CASKO14936 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CASKO14936 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASKO14936 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASKO14936 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASKO14936 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASKO14936 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASKO14936 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASKO14936 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASKO14936 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASKO14936 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASKO14936 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASKO14936 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASKO14936 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASKO14936 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASKO14936 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASKO14936 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASKO14936 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASKO14936 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASKO14936 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASKO14936 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASKO14936 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASKO14936 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASKO14936 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASKO14936 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASKO14936 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASKO14936 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASKO14936 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASKO14936 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASKO14936 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASKO14936 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASKO14936 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASKO14936 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms