Protein–RNA interactions for Protein: O14737

PDCD5, Programmed cell death protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD5O14737 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDCD5O14737 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDCD5O14737 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms