Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP56O00567 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP56O00567 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP56O00567 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP56O00567 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NOP56O00567 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP56O00567 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NOP56O00567 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NOP56O00567 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NOP56O00567 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NOP56O00567 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP56O00567 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP56O00567 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP56O00567 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP56O00567 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP56O00567 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOP56O00567 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP56O00567 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP56O00567 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP56O00567 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP56O00567 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP56O00567 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOP56O00567 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP56O00567 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP56O00567 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP56O00567 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP56O00567 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP56O00567 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP56O00567 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP56O00567 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP56O00567 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP56O00567 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOP56O00567 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP56O00567 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP56O00567 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP56O00567 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP56O00567 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP56O00567 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP56O00567 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOP56O00567 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP56O00567 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP56O00567 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP56O00567 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP56O00567 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP56O00567 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOP56O00567 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP56O00567 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP56O00567 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP56O00567 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP56O00567 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP56O00567 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NOP56O00567 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP56O00567 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP56O00567 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP56O00567 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP56O00567 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOP56O00567 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
NOP56O00567 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP56O00567 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP56O00567 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP56O00567 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP56O00567 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP56O00567 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP56O00567 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP56O00567 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP56O00567 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOP56O00567 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOP56O00567 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP56O00567 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP56O00567 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP56O00567 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP56O00567 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP56O00567 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP56O00567 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP56O00567 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOP56O00567 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP56O00567 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP56O00567 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOP56O00567 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP56O00567 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP56O00567 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP56O00567 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP56O00567 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP56O00567 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP56O00567 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP56O00567 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NOP56O00567 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP56O00567 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP56O00567 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOP56O00567 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms