Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC2LH3BP13 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC2LH3BP13 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms