Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NPIPB6E9PJ23 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NPIPB6E9PJ23 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NPIPB6E9PJ23 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms