Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TISP43B9A030 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TISP43B9A030 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TISP43B9A030 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TISP43B9A030 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TISP43B9A030 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TISP43B9A030 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TISP43B9A030 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TISP43B9A030 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TISP43B9A030 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms