Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRDCB7Z8K6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRDCB7Z8K6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRDCB7Z8K6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms