Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KNCNA6PVL3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KNCNA6PVL3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KNCNA6PVL3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms