Protein–RNA interactions for Protein: A6NLW8

DUXA, Double homeobox protein A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXAA6NLW8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DUXAA6NLW8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUXAA6NLW8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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