Protein–RNA interactions for Protein: A6NIX2

WTIP, Wilms tumor protein 1-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WTIPA6NIX2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
WTIPA6NIX2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
WTIPA6NIX2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
WTIPA6NIX2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms