Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEMP2A6NFY4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NEMP2A6NFY4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NEMP2A6NFY4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms