Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HELTA6NFD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HELTA6NFD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HELTA6NFD8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms