Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POTEFA5A3E0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POTEFA5A3E0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POTEFA5A3E0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms