Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TMEM89A2RUT3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM89A2RUT3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms