Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YYE9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YYE9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0J9YYE9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms