Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A0J9YVX5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A0J9YVX5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms