Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGSF9BQ9UPX0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms