Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH4Q9UIA0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYTH4Q9UIA0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms