Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK1NQ9UHG2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK1NQ9UHG2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK1NQ9UHG2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCSK1NQ9UHG2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCSK1NQ9UHG2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms