Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CPNE7Q9UBL6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CPNE7Q9UBL6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CPNE7Q9UBL6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CPNE7Q9UBL6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CPNE7Q9UBL6 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CPNE7Q9UBL6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CPNE7Q9UBL6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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