Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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USP35Q9P2H5 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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USP35Q9P2H5 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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USP35Q9P2H5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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USP35Q9P2H5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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USP35Q9P2H5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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USP35Q9P2H5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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USP35Q9P2H5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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USP35Q9P2H5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
USP35Q9P2H5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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