Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CNTN3Q9P232 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CNTN3Q9P232 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms