Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MIS18AQ9NYP9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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