Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXC10Q9NYD6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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