Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HCCAT5-202ENST00000642127 1029 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355922.2-201ENST00000557335 1398 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAML3-201ENST00000398940 831 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365214.1-201ENST00000404237 997 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL135937.1-201ENST00000418690 729 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC144NL-AS1-206ENST00000443508 1216 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00331-201ENST00000446391 376 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR7E26P-201ENST00000502808 1006 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02148-201ENST00000503877 1223 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012339.1-201ENST00000505564 941 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGEF38-IT1-201ENST00000512262 456 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms