Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MCMBPQ9BTE3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms