Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
KCNS3Q9BQ31 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
KCNS3Q9BQ31 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms