Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
NABP2Q9BQ15 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms