Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PHOX2BQ99453 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms