Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms