Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms