Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRAMP1Q96RY5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms