Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms