Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NMD3Q96D46 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NMD3Q96D46 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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