Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC112Q8NEF3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC112Q8NEF3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms