Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GDPD1Q8N9F7 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms