Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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