Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP34Q70CQ2 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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