Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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ATG16L1Q676U5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATG16L1Q676U5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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